U sukladnosti sa svojim mandatom utvrđenim na Madridskoj konferenciji Vijeća za provedbu mira, Ured visokog predstavnika je pozorno pratio i pružao svoju pomoć u istragama o korupciji i prijevari koje su se provodile u oba entiteta Bosne i Hercegovine. U okviru te politike, OHR podržava nedavno iskazane napore potpredsjednika Federacije, dr. Ejupa Ganića, u poticanju energičnijeg pristupa istragama i kaznenom gonjenju u takvim slučajevima. Prema izmjenama u federalnom zakonu o kaznenom postupku, od tužitelja Federacije i kantona se sada traži da zauzmu aktivniju ulogu u nadgledanju i koordinaciji kaznenih istraga. Kako bi se potaklo poštivanje novog zakona, potpredsjednik Ganić je zakazao sastanak sa federalnim tužiteljem i tužiteljima nekoliko kantona u cilju utvrđivanja statusa takvih slučajeva. OHR podržava ovu inicijativu.
Ekspertni tim OHR-a i IPTF-a je u Tuzli nadgledao istragu u svezi sa prijevarama i korupcijom, koja je pokrenuta na temelju navoda bivšeg guvernera kantona Izeta Hadžića. Eksperti OHR-a i IPTF-a izvješćuju da su federalna i kantonalna policija imale dobru zajedničku suradnju i da su provele vrlo detaljnu i profesionalnu istragu unatoč očitom pritisku koji su na njih vršili određeni pojedinci iz političkih krugova kako bi utjecali na i razvodnili istragu i kazneno gonjenje. Zatražena je pomoć federalne financijske policije, koja sada provodi neovisnu istragu KDRR-a.
OHR je pozorno pregledao izvješća o istrazi u Tuzli, koja su pripremili federalna i kantonalna policija, te se slaže sa preporukom federalne policije da se kaznena prijava proslijedi sucu istražitelju Kantonalnog suda u Tuzli. OHR također podržava rad federalne policije i federalne financijske policije u poticanju istraga protiv organiziranih kriminalnih radnji u Vladi Tuzlanskog kantona.
OHR traži hitno donošenje odluke u svezi sa istragama u slučaju Promdei banke i spora u svezi člana 26 Ugovora između BiH i Republike Hrvatske. Ove dvije istrage uključuju gubitak nekoliko milijuna njemačkih maraka. OHR pozorno prati ove slučajeve i nudi svoju pomoć i potporu.