У складу са својим мандатом утврђеним на Мадридској конференцији Савјета за имплементацију мира, Канцеларија високог представника је пажљиво пратила и пружала своју помоћ у истрагама о корупцији и превари које су се спроводиле у оба ентитета Босне и Херцеговине. У оквиру те политике, OHR подржава недавно исказане напоре потпредсједника Федерације др Ејупа Ганића, у подстицању енергичнијег приступа истрагама и кривичном гоњењу у таквим случајевима. Према измјенама у федералном закону о кривичном поступку, од тужилаца Федерације и кантона се сада тражи да заузму активнију улогу у надгледању и координацији кривичних истрага. Како би се подстакло поштовање новог закона, потпредсједник Ганић је заказао састанак са федералним тужиоцем и тужиоцима неколико кантона у циљу утврђивања статуса таквих случајева. OHR подржава ову иницијативу.
Експертски тим OHR-а и IPTF-а је у Тузли надгледао истрагу у вези са преварама и корупцијом која је покренута на основу навода бившег гувернера кантона Изета Хаџића. Експерти OHR-а и IPTF-а извјештавају да су федерална и кантонална полиција имале добру заједничку сарадњу и да су спровеле веома детаљну и професионалну истрагу упркос очигледном притиску који су на њих вршили одређени појединци из политичких кругова како би утицали на и разводнили истрагу и кривично гоњење. Затражена је помоћ федералне финансијске полиције, која сада спроводи независну истрагу KDRR-а.
OHR је пажљиво прегледао извјештаје о истрази у Тузли, које су припремиле федерална и кантонална полиција, те се слаже са препоруком федералне полиције да се кривична пријава прослиједи судији истражиоцу Кантоналног суда у Тузли. OHR такође подржава рад федералне полиције и федералне финансијске полиције у подстицању истрага против организованих криминалних радњи у Влади Тузланског кантона.
OHR тражи хитно доношење одлуке у вези са истрагама у случају Promdei банке и спора у вези члана 26 Уговора између БиХ и Републике Хрватске. Ове двије истраге укључују губитак неколико милиона њемачких марака. OHR пажљиво прати ове случајеве и нуди своју помоћ и подршку.